マネーフォワードなどの会計ソフトでは、ネットバンキングと連動することにより銀行の入出金の取引を自動的に会計ソフトに取り込むことができます。ただし、法人口座の場合、ネットバンキングの利用には、通常は月額手数料が毎月数千円程度かかります。

一部のネット銀行では、ネットバンキングの月額利用料が無料となっているところもありますので、
都市銀行などでの口座開設にこだわらないのであれば、これらの銀行を利用することも１つの方法と思います。

以下の銀行は、法人口座のネットバンキング月額利用料が無料となっており、またマネーフォワードへの連動が可能です（２０２２年１０月１日現在）

GMOあおぞらネット銀行
住信SBIネット銀行
PayPay銀行
楽天銀行

また、ネット銀行の場合、振込手数料も都市銀行などと比較して安くなっています。